Uniwersytet Papieski Jana Pawła II w Krakowie to historia, tradycja, a także pewnego rodzaju most łączący przeszłość z teraźniejszością. To nie tylko uczelnia, lecz znacznie więcej. Aby przekazać dokładną historię uczelni, należałoby cofnąć się do 1397 roku, w którym to ówczesny papież Bonifacy IX, na prośbę królowej Jadwigi i Władysława Jagiełły powołał do życia Wydział Teologii w Krakowie.

Współczesny Uniwersytet Papieski Jana Pawła II to nowoczesna uczelnia, wychodząca naprzeciw wymaganiom rynku pracy, jednocześnie zachowująca nieprzerwanie swój charakter i nieustannie prowadząca określoną misję. UPJPII należy do Międzynarodowej Federacji Uniwersytetów Katolickich, Uniwersyteckiej Sieci Europejskich Stolic Kultury, Konferencji Rektorów Uniwersytetów Polskich, jak również Konferencji Rektorów Akademickich Szkół Polskich. W kontekście naukowym, uczelnia zajmuje się badaniem i przekazywaniem wiedzy teologicznej, jak również z zakresu nauk humanistycznych, społecznych i sztuki.